当前,国家创新体系已成为世界创新发展的主流模式。日本始终遵循世界潮流充分发展国家创新体系。从明治维新,到二战后通过模仿和改进提升自身的技术水平,再到上世纪80年代后形成科学技术创造立国的战略国策,国家创新体系在其实现国家发展、经济赶超的过程中功不可没。其中,大学天然地成为国家创新体系中的一个重要主体,20世纪后更是深入参与国家创新体系建设。考察同属东亚文化圈的日本经验,探明大学是如何参与其国家创新体系建设的,可提炼供我国参考借鉴的经验启发。基于此,本研究一方面通过历史分析,对日本大学参与国家创新体系建设的史料进行梳理分析,总结出日本大学在国家创新体系的发展中共经历了三个阶段。明治和昭和时期,日本国家创新体系始建,大学初建,通过自我建构、人才培养、技术消化,成为国家创新体系其中一环;战后经济重建和发展期,日本国家创新体系重建并进一步发展,大学创新形式丰富,成为基础研究的主阵地,产学官合作体制成形;80年代以后日本国家创新体系肩负重任,大学参与国家创新体系建设的方式更加多元。另一方面选取数据指标,通过与国家创新体系中的其它创新主体的比较,分析大学参与国家创新体系建设的创新投入、产出、潜能等现有能力。研究发现,当前大学创新投入自我供给能力有限,依靠政府、企业等提供资金;创新产出上形式丰富、转化类型多样,产出数量高,但质量保障上仍有提高空间;创新潜力得到持续开发,但也存在后发力不足的风险。在历史和现状分析的基础上,总结日本大学参与国家创新体系建设特点和经验,可以发现日本大学参与国家创新体系建设过程中具有重视基础研究、主体客体环境三要素相协调、对外学习模仿与自我提升相结合的特点。对此,我们需要吸取日本大学经验,预防发展中可能存在的创新投入处于被动地位的问题以及产学体系中的现存问题,也需要学习日本充分重视大学创新产出、积极谋求创新合作,让政府助力大学创新潜能开发。