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有害藻华(Harmfulalgalblooms,HABs)是由浮游植物在水体中爆发引起的对人类社会与经济有害生态现象。随着近年来有害藻华频发，通过生物方法治理赤潮渐渐成为一种有效且洁净的方法。本论文围绕一株具有杀藻活性的藻际微生物Hahellasp.KA22，利用生物信息学的方法对其遗传结构及表达调控展开研究；并通过比较基因组学研究杀藻物质产生的机制，取得的主要研究成果如下：
1）本论文首先对海洋杀藻菌Hahellasp.KA22的表观性状及杀藻活性展开研究。通过对杀藻物质的提取分离纯化，并利用液相质谱联用仪以及傅里叶变换红外光谱仪进行鉴定，最终确定了杀藻物质为灵菌红素。同时经过一系列的细菌生理生化实验，揭示了菌株Hahellasp.KA22在抗生素抗性、细菌形态，单糖利用，酶学指纹图谱等方面的性状特性；通过杀藻实验，发现菌株Hahellasp.KA22产生的灵菌红素为一种高效杀藻物质，能够使赤潮异弯藻迅速裂解。
2）基因组图谱是研究生物基因组结构和遗传的最重要内容之一。对细菌Hahellasp.KA22基因组测序并组装后，我们得到了细菌Hahellasp.KA22的基因组完成图谱，其大小在6.9M左右，GC含量为53.91%。对基因组的注释结果表明，细菌Hahellasp.KA22基因组内具有完整的灵菌红素合成基因簇以及上下游的潜在调控元件。
3）比较基因组学和系统发育学是研究生物基因组功能和进化的重要内容。通过比对33株不同的灵菌红素产生菌的基因组，我们发现灵菌红素的产生模型大致可分为海洋与陆地生境两种；通过对基于灵菌红素序列构建的进化树及其它序列特征，如GC值等的分析，我们推测灵菌红素合成基因簇的进化历程可能是由陆地生境向海洋生境进化的，而且进化过程中，基因簇向着简并有序的方向发展。
4）转录组学是研究生物表达调控，阐释分子机理最重要的工具之一。利用转录组学及网络分析的方法，我们对菌株Hahellasp.KA22产灵菌红素的基因簇表达以及调控模型进行研究，发现灵菌红素合成基因簇合成调控十分复杂，受到不仅受到ChrR、RpoE还能够受到全局调控因子c-di-GMP的间接调控。
本论文研究揭示了杀藻菌Hahellasp.KA22灵菌红素遗传结构与合成调控机制，阐明了不同灵菌红素产生菌及其基因组的进化背景，可以丰富人们对杀藻菌的遗传特征及杀藻机制的认知。
1）本论文首先对海洋杀藻菌Hahellasp.KA22的表观性状及杀藻活性展开研究。通过对杀藻物质的提取分离纯化，并利用液相质谱联用仪以及傅里叶变换红外光谱仪进行鉴定，最终确定了杀藻物质为灵菌红素。同时经过一系列的细菌生理生化实验，揭示了菌株Hahellasp.KA22在抗生素抗性、细菌形态，单糖利用，酶学指纹图谱等方面的性状特性；通过杀藻实验，发现菌株Hahellasp.KA22产生的灵菌红素为一种高效杀藻物质，能够使赤潮异弯藻迅速裂解。
2）基因组图谱是研究生物基因组结构和遗传的最重要内容之一。对细菌Hahellasp.KA22基因组测序并组装后，我们得到了细菌Hahellasp.KA22的基因组完成图谱，其大小在6.9M左右，GC含量为53.91%。对基因组的注释结果表明，细菌Hahellasp.KA22基因组内具有完整的灵菌红素合成基因簇以及上下游的潜在调控元件。
3）比较基因组学和系统发育学是研究生物基因组功能和进化的重要内容。通过比对33株不同的灵菌红素产生菌的基因组，我们发现灵菌红素的产生模型大致可分为海洋与陆地生境两种；通过对基于灵菌红素序列构建的进化树及其它序列特征，如GC值等的分析，我们推测灵菌红素合成基因簇的进化历程可能是由陆地生境向海洋生境进化的，而且进化过程中，基因簇向着简并有序的方向发展。
4）转录组学是研究生物表达调控，阐释分子机理最重要的工具之一。利用转录组学及网络分析的方法，我们对菌株Hahellasp.KA22产灵菌红素的基因簇表达以及调控模型进行研究，发现灵菌红素合成基因簇合成调控十分复杂，受到不仅受到ChrR、RpoE还能够受到全局调控因子c-di-GMP的间接调控。
本论文研究揭示了杀藻菌Hahellasp.KA22灵菌红素遗传结构与合成调控机制，阐明了不同灵菌红素产生菌及其基因组的进化背景，可以丰富人们对杀藻菌的遗传特征及杀藻机制的认知。