在近几年来,新三板市场的影响力随着该市场的迅速崛起越来越显著,经济市场的多元化发展和政府有力政策的扶持,为新三板能够更长远的发展创造了良好的环境。但是,新三板市场发展时间比较短,相关的政策制度和监管还不够完善,出现一些财务舞弊等问题,造成投资者经济利益上的损害,同时审计风险也在不断的加大。本文理论结合案例为新三板市场能够更长远的发展提出相关建议。本文运用了文献调查法和案例研究法,通过翻阅国内外文献、借鉴风险导向审计理论和企业风险管理理论作为理论基础,新三板市场第一例被监管机构处罚的参仙源财务舞弊案作为案例进行分析。总结了新三板挂牌企业的审计风险控制的原因有:企业持续经营能力不足、内部控制制度不完善、关联方交易不公允、审计人员能力不足以及会计师事务所质量控制存在问题等。并根据相关的风险因素和新三板市场审计的特点提出了风险应对策略:审计人员在审计工作中要根据新三板的特点制定审计计划同时要贯彻风险导向理论、重点关注企业的持续经营能力、加强内部控制和关联方交易的审计工作、也要提升注册会计师的专业水平,并且要通过外部监管来保障会计师事务所的审计质量控制。虽然新三板市场的特点增加了审计风险,希望可以通过参仙源风险失控案的分析能够对新三板挂牌企业的审计风险控制的内容起到补充的作用,从而让新三板市场审计工作的质量能得到保障和完善,降低审计风险。