【摘 要】
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哈维氏弧菌主要分布于海洋环境和海洋生物体中,是多种海洋鱼类和无脊椎动物的条件致病菌,目前关于哈维氏弧菌抗喹诺酮药物的机制研究较为缺乏.通过RNA-seq技术对临床分离的哈维氏弧菌敏感菌株(VS)和耐药株(VR)进行比较转录组测序,经从头拼接(De nove)再组装共得到2,082条Unigene.通过比对,两个样品共鉴定出129个差异表达基因,耐药菌与敏感菌相比有65个基因上调,64个下调.对这些
【机 构】
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广东海洋大学水产学院、广东省水产经济动物病原生物学及流行病学重点实验室,广东湛江524088
【出 处】
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第八届全国微生物资源学术暨国家微生物资源平台运行服务研讨会
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哈维氏弧菌主要分布于海洋环境和海洋生物体中,是多种海洋鱼类和无脊椎动物的条件致病菌,目前关于哈维氏弧菌抗喹诺酮药物的机制研究较为缺乏.通过RNA-seq技术对临床分离的哈维氏弧菌敏感菌株(VS)和耐药株(VR)进行比较转录组测序,经从头拼接(De nove)再组装共得到2,082条Unigene.通过比对,两个样品共鉴定出129个差异表达基因,耐药菌与敏感菌相比有65个基因上调,64个下调.对这些差异表达基因进行功能注释和富集分析,发现双组份系统(ko02020)、ABC转运系统(ko02010)、鞭毛组装(ko02040)通路显著富集,并找到与哈维氏弧菌喹诺酮耐药相关的9个基因.转录组数据揭示哈维氏弧菌的耐药机制除了经典的靶位点突变外,主动外排系统、双组份系统与鞭毛组装等调节机制也参与了耐药的形成.同时,利用荧光定量PCR技术在优化的反应条件下,对转录组筛选到的10个差异表达基因进行定量表达分析,结果与转录组分析的基因表达变化趋势基本一致,进一步证实了转录组测序和数据分析的可靠性.
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