【摘 要】
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该研究使用癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)数据库中的卵巢癌(ovarian cancer,OC)数据集对患者进行有关CXCR3的生存及差异表达基因分析,再对CXCR3high组的差异表达基因进行京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)富集分析.同时,使用单样本基因集富集分析(Single Sample Gene Set Enrichment Analysis,ssGSEA)方法分析OC组织
【机 构】
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上海交通大学医学院附属仁济医院(上海市妇科肿瘤重点实验室)妇产科,上海 200127
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该研究使用癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)数据库中的卵巢癌(ovarian cancer,OC)数据集对患者进行有关CXCR3的生存及差异表达基因分析,再对CXCR3high组的差异表达基因进行京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)富集分析.同时,使用单样本基因集富集分析(Single Sample Gene Set Enrichment Analysis,ssGSEA)方法分析OC组织中各免疫细胞组分CXCR3表达水平,评估其与各免疫细胞组分表达间的相关性.研究结果显示,OC组织中CXCR3高表达是患者预后良好的预测基因;肿瘤组织中CXCR3表达与PD-1/PD-L1通路及Th1分化通路密切关联,并可能在这两条通路中发挥关键的生物学功能;CXCR3高表达与肿瘤微环境中CD8+T细胞、CTL及DC的富集显著相关(r值为0.48、0.75和0.64).由此,CXCR3在肿瘤局部免疫效应细胞募集、机体抗肿瘤免疫应答中具有重要作用,其有望成为筛选适合免疫治疗OC患者的生物标志物之一.
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