沼液不仅是很好的叶面肥，而且具有良好的病虫防治作用，可代替或作为农药的辅助剂使用以防控农作物或果树病虫害的发生及为害。 由于其无污染、无残留、成本低、使用简单，且具有药肥合一的效果，生产中很受农民欢迎，尤其在生产绿色无公害及有机农产品方面有着极为广阔的应用前景。
　　1.沼液防治病虫害的机理
　　沼液含有丰富的氮、磷、钾、铜、锌、锰等营养元素，且含有17 种氨基酸活性酶，其所含的乙酸、丁酸、丙酸、乳酸菌、芽胞杆菌、维生素B、赤霉素、吲哚乙酸以及氨、铵盐和一些抗生素等成分是沼液抗病防虫的主要因素。另外，沼液中产生的乙烯、脱落酸等物质能激发作物抗逆性反应，而沼液本身的营养作用使作物生长势增强，提高了抗病虫能力。
　　2.沼液的选择与处理
　　2.1沼液选择 选择正常发酵产气3个月以上沼气池所产生的沼液，并且符合沼肥无害化施用卫生指标，酸化池、中毒池、正常产气不足3个月沼气池的沼液不能使用。
　　2.2沼液处理 打开沼气池水压间盖，将沼液暴露在空气中5～7天，期间应多次搅动，使溶解在沼液中的硫化氢气体充分逸散，之后将液面的浮渣清除后即可使用。
　　3.防治农作物病虫害
　　3.1沼液浸种 使用沼液浸种既能起到消毒作用，又能提高种子发芽率。可将种子置于沼液（如浓度过高应适当稀释）中进行浸泡，一般有壳种子浸10～24小时，无壳种子浸2～10小时即可，浸种时间以种子吸足水分为宜，过长则影响发芽，浸过的种子应用清水淘净，然后催芽或播种。
　　3.2喷施沼液 病虫害发生初期使用纯沼液（气温高或作物较为幼嫩时可适当稀释）进行叶面喷施，间隔7～10天一次，连续2～3次；病虫发生盛期需加入对应农药以更有效控制其为害，且间隔天数适当减少，可3～4天一次，喷施次数要相应增加，直至消灭病虫害。生产中使用沼液防治农作物蚜虫、玉米螟、白粉病、大小斑病、赤霉病等均可取得良好效果。防治玉米螟可在幼虫孵化盛期，亩用纯沼液50kg，加入2.5%敌杀死乳油10mL配成药液进行喷施；防治小麦蚜虫亩用沼液50 kg加入10%洗衣粉1kg进行喷施，严重时可加入10%吡虫啉10mL效果更好。
　　3.3灌根防病虫 病虫害发生初期使用纯沼液（幼苗期应适当稀释以防“烧苗”）灌根。例如生产中采用沼液灌根防治韭蛆，可于春季扒开韭菜根部土壤，在有韭蛆白色幼虫出现的地方，用沼液顺行沟灌或垄灌，使沼液下渗土壤深度为10～15cm，可有效杀死土壤中的韭蛆幼虫。沼液也用于防治西瓜枯萎病，可于发病前将沼液稀释1～2倍（稀释倍数根据瓜苗长势而定）进行灌根，每株用量1～1.5kg，连续2～3次，既能很好预防枯萎病，又能提供养分，促使瓜苗健壮。
　　4.防治果树病虫害
　　4.1叶面喷施 采用纯沼液直接喷施，气温高时适当稀释，每隔10～15天一次，可有效防治蚜虫、卷叶虫、红蜘蛛、金龟子、蝽象等害虫，同时兼治早期落叶病、缩果病、小叶病和花叶病。
　　4.2沼液灌根 结合叶面喷施进行，用清水稀释沼液2～3倍，在树冠外围挖10～15cm浅沟，每株15kg，每隔20天浇施1次。用于防治苹果树根腐病、黄叶病、小叶病等。
　　5.注意事项
　　选择适当时期使用，一般以病虫发生初期防治效果较好，如错过防治适期或防效较差时可加入农药增强防效，但须注意农药与沼液的酸碱度要一致，以免降低防治效果；一般采用纯沼液使用，叶面喷施时要侧重叶片背面，且尽量避免在中午气温高时喷施，以免灼烧叶片。