概率决策树在生物信息数据库中的一个应用

来源 :计算机工程与应用 | 被引量 : 0次 | 上传用户：chinetman

【摘要】

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GO(Gene Ontology)是个标准化的生物信息本体库，被广泛地用来注释基因数据库，然而由于GO结构设计上的缺陷以及目前对基因数据库注释方法多采用手工方式，再加上基因的许多特性尚

【作者】

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彭政鲁鸣鸣

【机构】

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复旦大学计算机科学与工程系,复旦大学智能信息处理实验室

【出处】

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计算机工程与应用

【发表日期】

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2004年25期

【关键词】

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机器学习概率决策树本体生物信息基因 machine learning probabilistic decision tree Ontology bioi

【基金项目】

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国家自然科学基金项目(编号:60273045),,科学技术部基础研究重大项目前期研究项目(编号:2001CCA0300),,上海市科技发展基金项目(编号:025115032)资助

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GO(Gene Ontology)是个标准化的生物信息本体库，被广泛地用来注释基因数据库，然而由于GO结构设计上的缺陷以及目前对基因数据库注释方法多采用手工方式，再加上基因的许多特性尚未发现，使得这种注释还不完全。该文尝试用概率决策树的方法来学习得到基因和GO本体的内在联系，进而预测基因的本体注释情况，也就是预测基因的未知特性，这样就可以引导基因数据库管理员去完善，修正基因数据库的本体注释，并指导生物学家有针对性地设计试验。作为一个应用，用MGI基因数据数据库做试验，分析表明用该方法得到的预测结果准确性比

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