薄型子宫内膜大鼠模型microRNAs差异表达的研究

来源 :辽宁中医药大学学报 | 被引量 : 0次 | 上传用户:Z_PEPSI
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目的:对薄型子宫内膜大鼠模型差异microRNAs进行筛选和靶基因预测,并对其进行生物信息学分析。方法:采用95%乙醇宫腔灌注制备大鼠薄型子宫内膜模型,取模型组及正常对照组的大鼠子宫内膜组织进行总RNA提取、RNA质检、文库构建后,使用测序平台为illumina HiSeqTM2500进行高通量测序,以P<0.05的标准筛选差异miRNA,利用miRanda和RNAhybrid得出差异表达miRNA候选靶基因,进行GO、KEGG富集分析。结果:共有52个差异miRNA,符合预测要求的有48个差异miRNA,共预测出1530个靶基因。其中表达上调的miRNA为rno-miR-375-3p、rno-miR-292-3p、rno-miR-129-1-3p、rno-miR-129-2-3p、rno-miR-291a-3p等,表达下调的miRNA为rno-miR-144-3p、rno-miR-542-3p、rno-miR-144-5p等,涉及的生物过程主要涉及肽基-苏氨酸磷酸化修饰、细胞代谢过程调控、树突状细胞凋亡过程的调控;细胞成分主要包括细胞内细胞器、胞质、肌动蛋白细胞骨架、细胞骨架部分;分子功能主要涉及转移酶活性、小分子结合、RNA聚合酶III转录调控区序列特异性DNA等方面。涉及的KEGG信号通路有Ras信号通路、胰岛素信号通路。结论:薄型子宫内膜的发病可能与rno-miR-375-3p、rno-miR-292-3p、rno-miR-129-1-3p、rno-miR-129-2-3p、rno-miR-291a-3p、rno-miR-144-3p、rno-miR-542-3p、rno-miR-144-5p等miRNA表达相关,可能涉及的KEGG信号通路有Ras信号通路、胰岛素信号通路等。
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