【摘 要】
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藤黄节杆菌(Arthrobacter luteus, A. luteus) ATCC 21606是一种革兰氏阳性短杆状的放线菌。该菌分泌的溶菌酶(Lyticase)能够有效裂解酵母细胞壁,同时它也能分泌限制性核酸内
【机 构】
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重庆医科大学基础医学院生物化学与分子生物学教研室; 北京大学生命科学学院蛋白质与植物基因研究国家重点实验室;
【基金项目】
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国家自然科学基金重点项目(31730022);国家自然科学基金国际合作项目(NSFC-ISF,31661143032)共同资助;科技部国家重点研发计划(2016YFA0500300)
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藤黄节杆菌(Arthrobacter luteus, A. luteus) ATCC 21606是一种革兰氏阳性短杆状的放线菌。该菌分泌的溶菌酶(Lyticase)能够有效裂解酵母细胞壁,同时它也能分泌限制性核酸内切酶Alu I和热稳定的黄嘌呤氧化酶,但目前还没有该菌株的全基因组序列相关的报导。本研究首先通过对A. luteus ATCC 21606菌株的基因组进行高通量测序;再利用SOAPdenovo、GeneMarks等软件对基因组进行组装和组分分析;接着与COG、GO、KEGG、NR、Swiss-Prot和CAZy数据库比对进行基因功能注释;并利用antiSMASH软件进行次级代谢产物合成基因簇预测;最终得到大小为4 209 480 bp的全基因组序列,GC含量为74.68%,共预测到编码基因3 741个。基因序列已提交至美国国立生物技术信息中心(NCBI)的GenBank数据库,登录号为RQIK00000000。本研究首次报导了A. luteus ATCC 21606的全基因组序列,为后续该菌株的功能基因、代谢产物合成途径及比较基因组学等相关研究提供基础。
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