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目的： 肝细胞癌（Hepatocellular carcinoma，HCC）是一种预后差的恶性肿瘤，手术切除仍是目前最主要的治疗方法，而术后肝内复发是治疗失败的最重要原因。16号染色体（Chromosome16，Chr16）拷贝数变异（Copy number aberration，CNA）频繁发生于 HCC中，研究发现其与多种肿瘤的临床预后密切相关。本研究旨在探讨 Chr16 CNAs与 HCC术后肝内复发的相关性，并筛选复发相关CNA片段上的差异表达基因。 方法： 1．采用微阵列比较基因组杂交（Array comparative genomic hybridization，aCGH）平台检测具有完整术后复发随访资料（随访时间3~73个月）的66例HCC样本的Chr16 CNAs情况。应用 Log-rank检验，Kaplan-Meier生存分析及多因素 Cox风险比例模型（Cox proportional hazards models）分析 Chr16 CNAs与HCC术后肝内复发的相关性。 2．对109例样本进行 aCGH和基因表达联合分析，筛选 HCC肝内复发相关 CNA片段上的差异表达基因。基因 mRNA表达的组间比较采用 Mann-Whitney U检验。 结果： 1．66例 HCC中，16号染色体长臂（16q）丢失占62.1％，短臂（16p）丢失占51.5%。Chr16高频（发生率＞20%） CNA片段共6个，均为丢失片段：16p13.3-13.2、16p13.11、16q11.2-22.1、16q22.1、16q22.2-24.2和16q24.2。生存分析显示，仅16q22.1丢失与 HCC术后肝内复发显著相关（Log-rank检验，P=0.025）。多因素 Cox回归分析显示，16q22.1丢失是肝内复发的独立危险因素（HR=2.32,95%CI=1.26～4.27，P=0.007）。 2．在 HCC复发相关16q22.1片段内，有21个基因（FAM96B、CBFB、C16 orf70、TRADD、ELMO3、TMEM208、ATP6 V0 D1、FAM65 A、CTCF、GFOD2、RANBP10、THAP11、NUTF2、EDC4、PSMB10、DDX28、DUS2L、NFATC3、ESRP2、SLC7 A6和 SLC7 A6 OS）的mRNA表达水平在16 q22.1丢失HCC组显著低于无丢失 HCC组（FDR-q<0.05，P≤0.001）。 结论： 1．16q22.1丢失是 HCC术后肝内复发的独立危险因素，可作为 HCC复发的预测分子标志。 2．16 q22.1丢失片断内 TRADD、PSMB10、THAP11、CTCF和ESRP2等多个候选肿瘤抑制基因呈低表达，可能共同参与了 HCC复发的演进过程。