对外来入侵物种进行科学的风险分析是建立入侵生物预警系统和防范其入侵的重要途径。根据生物入侵过程中的传入、定殖和扩散阶段，以红火蚁、梨火疫病菌、桔小实蝇为模式生物进行了风险评估。以梨火疫病随进境苹果果实传入的可能性为例，利用Monte-Carlo模拟方法来评估有害生物的入侵风险。按照4种不同场景分别建立β分布来拟合入境水果中感染梨火疫病的比率。模拟表明，对入境苹果果实无任何检疫要求的情形下，出现发病的最少年份为14年。传入风险随入境数量的增加而增加。根据红火蚁的生物学特性，确定其适生的生态气候指标为：一年中稳定通过发育起点温度的天数，有效积温值，年降水量，海拔高度。应用地理信息系统(GIS)空间分析模块中的插值功能，获得上述四个生态因子的栅格图层，截取各个图层的重叠部分，得到红火蚁在我国的适生性分布情况。苹果开花期的温度和降水量是影响梨火疫病菌分布的关键气候因子，根据这一生物学特性及生态环境因子，预测了梨火疫病在欧洲的发生情况，结果与其历史分布记录相符。使用相同的空间建模方法对梨火疫病在我国渤海湾和黄土高原两个苹果优势栽培产区的潜在定殖区域进行风险评估，结果表明这两大苹果产区中优先扶持的县大多处于梨火疫病发生的高风险范围。基于桔小实蝇在我国的已知分布点数据和亚洲地区的14个环境地理变量图层，运用GARP生态位模型结合GIS空间分析模块预测了该害虫在亚洲的地理分布。将拟合过程中获得的生态位运算法则投影到我国，预测桔小实蝇在各省和市县范围的分布。结果表明，在我国的大多适生区和次适生区都有较高密度的寄主果树，为桔小实蝇的生存提供了条件。利用CLIMEX模型作为预测工具，在目前的气候条件下评估了梨火疫病在全球范围内可能的扩散地区。梨火疫病在北美和欧洲的分布资料用来调试CLIMEX参数，直到预测区域和实际分布达到最大吻合。利用调试后的参数预测在世界其它地区的分布。结果表明，温带气候和海洋性气候的地区，适宜梨火疫病的发生。结合我国的六大苹果产区，分析了对我国苹果生产的潜在风险。在上述风险评估的基础上提炼理论、模式和技术体系，构建病、虫等不同类型生物入侵风险评估的模式与技术体系。初步建立了一套潜在危险生物入侵早期预警技术平台和体系，为建立农林危险入侵生物信息管理系统、制定外来危险生物黑色/灰色/白色名录和实施全面检疫措施提供科学依据。