基于我国制药研发回报机制不完善和高风险、高回报的背景,本文以研发投入对我国制药上市公司股票价格的影响机制为研究对象,旨在提升研发投入对制药上市公司股票价格的影响,改善我国制药研发回报机制。基于相关理论基础与文献综述,本文分析了研发投入对化学制药上市公司、中药制药上市公司和生物制药上市公司股票价格的影响现状,以及研发投入对制药上市公司股票价格的影响因素,即研发投入信息披露、研发投入总量和研发投入结构。研究基于信息观和基于信息不对称的研发投入信息披露对制药上市公司股票价格影响机制,基于C-D生产函数的研发投入总量对制药上市公司股票价格影响机制,以及基于研发投入资本化与费用化处理的研发投入结构对制药上市公司股票价格影响机制。对于提升研发投入对制药上市公司股票价格的影响,提出如下对策建议:第一,改善研发投入信息披露环境。证监部门规范研发投入信息披露制度,审计部门严格保证制药上市公司研发投入信息客观性,公开制药上市公司研发投入信息披露渠道,投资者提高对制药上市公司研发投入信息的重视。第二,适当加大制药上市公司研发投入资金总量。政府加大对制药上市公司研发支持,银行加大对制药上市公司研发贷款力度,制药上市公司注重保护知识产权和优化研发人员结构。第三,合理规划制药上市公司研发投入结构。审计部门加强监管力度,制药上市公司增强规划研发投入结构的自主意识。最后,本文得出如下研究结论:第一,信息观和信息不对称是研发投入信息披露对制药上市公司股票价格影响的传导机制。第二,C-D生产函数是研发投入总量对制药上市公司股票价格影响的传导机制。第三,研发投入的资本化与费用化处理是研发投入结构对制药上市公司股票价格影响的传导机制。第四,基于信息观的影响机制认为,研发投入数值信息披露偏差与制药上市公司股票价格估值偏差方向相同。第五,基于C-D生产函数的影响机制认为,研发投入总量正向影响制药上市公司股票价格。第六,基于研发投入资本化与费用化处理的影响机制认为,研发投入结构对制药上市公司股票价格存在正向与负向影响。