运用线粒体DNA COI和Cytb、ITS-1序列片段、ISSR，分别对我国五大淡水湖：洞庭湖(DT)、太湖(TH)、巢湖(CH)、洪泽湖(HZ)，及鄱阳湖内进贤(PJ)、余干(PY)、珠湖(PZ)、都昌(PD)、湖口(PH)、永修(YX)合计10个群体三角帆蚌的遗传多样性和亲缘关系进行了研究。 对10个群体三角帆蚌69个个体线粒体DNA COI和Cytb进行PCR扩增、序列测定，获得同源基因序列。同源基因序列分析显示，mtDNA COI Cytb基因片段中，A+T含量都明显大于G+C含量。mtDNA COI和Cytb中分别检测到42个和40个单倍型，332个和329个核苷酸多态位点。mtDNA COI和Cytb基因序列的遗传距离表明，五大湖群体间遗传距离较远，群体之间的遗传距离分别为0.0111到0.0422之间和0.O101到0.0412之间，各为独立的种群；鄱阳湖六个点群体间遗传距离很近，分别仅为0.0021到0.0073之间和0.0012到0.0051之间，为一个种群。mtDNA COI和Cytb分子系统树都显示，鄱阳湖6个群体聚在一起，并与巢湖群体亲缘关系相近，然后鄱阳湖、巢湖这二个群体再和太湖群体聚在一起。洞庭湖群体和洪泽湖群体亲缘关系相近，单独为一支。 对10个群体三角帆蚌78个个体核糖体DNA基因转录间隔子ITS-1进行PCR扩增、序列测定，获得78条长度为430bp的同源序列。同源基因序列分析显示，五大淡水湖10个群体三角帆蚌78条ITS-1序列片段，G+C的含量都明显高于A+T的含量。鄱阳湖三角帆蚌的核苷酸多态性指数最高，而巢湖的核苷酸多样性指数最低。基于ITS-1序列片段的遗传距离表明，鄱阳湖内六个点群体间遗传距离很小，在0.0071到0.0092之间。五大湖间三角帆蚌群体遗传距离较远，在0.0752到0.1381之间。ITS-1序列片段构建系统树显示，鄱阳湖6个群体聚在了一起为单独一支，并与巢湖群体亲缘关系相近。洞庭湖群体和洪泽湖群体亲缘关系相近，单独为一支。太湖群体从鄱阳湖、巢湖群体分离开来，单独为一支。 运用ISSR对10个群体三角帆蚌进行研究。利用筛选获得的5条ISSR引物进行PCR扩增，POPGENE结果分析。计算Na、Ne、H和I各项数值，发现鄱阳湖的遗传多样性最高，洪泽湖群体最低。遗传距离计算表明，鄱阳湖内六个点群体间遗传距离相对较近，遗传距离在0.0143到0.0561之间，五大湖间群体遗传距离相对较远，遗传距离在0.1637到0.3341之间。系统树构建显示，鄱阳湖6个群体聚在一起，并与巢湖群体亲缘关系相近，然后鄱阳湖、巢湖这二个群体再和太湖群体聚在一起。洞庭湖群体和洪泽湖群体亲缘关系相近，单独为一支。