衰老相关的外周全血基因表达与DNA甲基化标志物的可重复性

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衰老的主要特征是生理功能的退化,这种退化具有较大的个体差异性。确定可靠、易测的衰老生物学标志物以代替时序年龄进行衰老评估对阿兹海默症(Alzheimer’s disease)等衰老相关疾病的发病机理研究及辅助诊断具有重要的意义。利用易于临床获取的外周全血,越来越多的研究发现了一些在外周全血中与衰老相关的基因表达与DNA甲基化标志物,但目前还缺少研究系统地评价这些衰老相关标志物的可重复性。我们首先利用来自不同实验室的多套外周全血的表达谱和甲基化谱数据集,分别分析了由独立数据集获得的与衰老相关的基因表达和DNA甲基化标志物是否具有显著的一致性。结果发现在不同数据集中找到的与年龄相关的差异表达基因(age-associated differentially expressed genes,aDEG)或差异甲基化位点(age-associated differentially methylated sites,aDMS)均具有显著的一致性(p<4.72*E-05),表明利用芯片高通量技术在全血中获得的与衰老相关的基因表达与DNA甲基化标志物具有可重复性。我们进一步利用去卷积算法估计了各样本中主要白细胞亚型的比例,并分析了特定亚型白细胞上衰老相关分子的改变。结果显示:(1)随着年龄增加,全血中髓系细胞的比例显著增加而淋巴细胞的比例显著减少;(2)在全血中观察到的aDEG主要反映血细胞的组分随年龄改变而产生的差异表达信号;(3)在全血中观察到的aDMS主要反映血细胞上的甲基化异常。最后,我们分别将在正常人外周全血中观察到的aDEG、aDMS与在阿兹海默症患者的外周全血或白细胞中发现的相应分子标志物进行比较,结果显示:(1)和整个年龄段的aDMS相比,在外周全血中65岁以上的aDMS与阿兹海默症相关的差异甲基化基因有较高的一致性,其中已知一些基因可作为潜在的阿兹海默症的分子标记;(2)血细胞上的aDEG与阿兹海默症相关的差异表达基因之间没有显著的关联。综上所述,我们的研究证实了在外周全血中发现的与年龄相关的基因表达和DNA甲基化标志物均具有显著的可重复性。随着年龄增加,各血细胞亚型的比例会发生改变并会对在外周全血中观察到的基因表达标志物产生显著的影响,而对在外周全血中DNA甲基化标志物的影响相对较小。在外周全血中65岁以上年龄段的aDMS可作为潜在的阿兹海默症的分子标记,值得进一步研究。
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