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经过多年的社会生产实践,大家发现了一个规律那就是:戈壁驼的体格和产肉量比沙漠驼普遍都大的多。在这个基础上,本文以阿拉善戈壁驼和沙漠驼的股二头肌为研究对象,探索两种骆驼产肉量发生差异的分子机制。采用高通量转录组测序(RNA-seq)技术筛选出阿拉善戈壁驼和沙漠驼股二头肌组织差异表达基因。利用数据库对差异基因进行GO功能注释和信号通路分析。本研究的主要结果如下显示:(1)高通量转录组测序结果显示,阿拉善沙漠驼5个样本得到的总Reads数分别是 47100696/63323176/5197540/49347678/61617914,其中 clean Reads 数分别是46041008/62211266/50906716/48313858/60988046,戈壁驼 5 个样本得到的总 Reads数分别是 53658154/59330764/56583910/46423336/65432244;Clean reads 数分别是52687830/58009318/54861640/45504318/64529048,Clean reads 数占比都达 90%以上,这表明测序结果饱和度良好,测序数据真实可信。(2)对测序数据进行分析,筛选到489个差异基因,以沙漠驼(SG)为参考组,其中377个为上调基因,112个为下调基因。(3)GO功能显著富集到的分类条目一共有484个,其中和生物学过程(biological process)相关的显著性富集条目有246个,所占比例为50.8%;与分子功能(molecular function)相关的显著性富集条目有184个,所占比例为38.1%;与细胞成分(cellular component)相关的显著性富集条目有54个,所占比例为11.1%。股二头肌差异表达基因中已经注释到的基因有5695个,其中参与生物学过程的基因148个,与细胞成分(cellular component)相关的基因有66个,分子功能(molecular function)相关的基因233个。(4)KEGG pathway通路富集分析,结果发现KEGG数据库注释的差异表达基因有6116个,pathway显著性富集分析发现这些基因参与了 250条生物学代谢通路,其中有19条存在极显著差异(p<0.01)。其中参与骨骼肌发育的差异基因有37个,参与脂肪代谢的差异基因有13个。(5)筛选与骨的形成、骨骼肌发育、脂肪沉积相关的差异基因:FOXO1、UNDT4、HABP2、HSPA5、EGR1、SAV1、UBE2D1、MAT2A、SLC25A25、CREB、JUN、AMD1、PLIN、OTUD1、CDKN1A、PPM1B、KLF6、ARPP19、LPIN1、ATF4、ARRDC2、VGLL2。本实验首次对阿拉善沙漠驼和戈壁驼股二头肌进行转录组分析,为完善阿拉善双峰驼基因文库提供理论依据,同时为改良家畜品种奠定基础。