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目的：通过分析长链非编码RNA基因HOTAIE在乳腺癌及癌旁组织中的表达水平,应用甲基化特异性PCR(methylation-specificPCR, MSP)技术,分析乳腺癌及癌旁组织中HOTAIE基因DNA的甲基化状态,探讨HOTAIE基因DNA甲基化与其表达的关系。方法：收集乳腺癌及癌旁正常组织30对,癌旁正常组织选取距离癌组织肿块边缘至少5cm以上的乳腺组织作为癌旁乳腺组织。分别提取总RNA,采用实时荧光定量PCR检测HOTAIR基因的表达。取30例乳腺癌组织及癌旁正常组织,分别提取基因组DNA,用亚硫酸盐处理,设计相应的甲基化和非甲基化序列引物并行PCR扩增,通过琼脂糖凝胶电泳分析,确定与引物互补的DNA序列的甲基化状态。所得数据进行统计学分析结果：1.在对乳腺癌及相匹配正常组织进行实时荧光定量检测后我们发现：乳腺癌组织中HOTAIR表达量为11.16±3.97,癌旁正常组织中HOTAIR的表达量为5.02±2.58,P=0.000,P<0.05,差异有统计学意义。2.经过MSP检测,我们发现乳腺癌组织中HOTAIR出现非甲基化27例,甲基化3例；而癌旁组织中出现未甲基化17例,甲基化13例,P=0.004<0.05,差异有统计学意义。结论：1.乳腺组织中可检测到HOTAIR处于活性表达状态；在乳腺癌组织中,HOTAIR的表达量明显高于癌旁正常组织,差异有统计学意义(P=0.000)。以上结果提示：HOTAIR的高表达可能与乳腺癌的发生有关联。2.乳腺癌组织中以及癌旁正常组织中可见HOTAIR基因启动子CpG岛非甲基化水平高于癌旁组织,且经统计学分析后证实二者之间差异有统计学意义(P=0.004)。以上结果提示：DNA非甲基化可能是HOTAIR基因在乳腺癌组织中高表达的原因之一。3.本实验研究结果发现,基因HOTAIR启动子CpG岛的非甲基化状态与该基因在乳腺癌组织中高表达有关,可能在乳腺癌的发生过程中起重要作用。本实验结果为HOTAIR基因甲基化水平成为检测乳腺癌的新的特异性指标提供了理论依据,并可能成为治疗乳腺癌的特异性潜在生物靶点。但是由于HOTAIR启动区具有多个甲基化区域,要深入研究还需要对多个区域进行定量和定性分析,以最终确定HOTAIR甲基化水平与乳腺癌的具体关系。