为探究异质性企业创新投入主要资金渠道及其伴随经济环境波动而产生的变迁趋势,本文基于创新投入对资金来源的敏感度,使用2007年至2015年沪深两市企业数据,研究发现:(1)国有企业创新投入资金主要来源为政府补助,非国有企业则为内部融资;(2)高技术企业创新投入资金主要来源为政府补助,而非高技术企业则为内部融资;(3)随着经济环境波动,2007年至2015年间上市企业创新投入资金主要来源呈现出“政府补助→内部融资与股权融资→政府补助”的变迁趋势;(4)就国内上市企业整体而言,创新投入的主要资金渠道则为政府补助,并且当创新投入主要资金渠道波动时,企业主要依赖内部融资进行平滑,其次则依赖股权融资,而债务融资并不能产生平滑效果,此外,本文还发现,在融资约束程度较高的企业中,上述平滑效果更为明显。上述结论表明企业创新投入资金主要来源因企业性质不同而存在差异,并且当外部经济环境不佳时企业倾向于使用政府补助开展创新活动。同时也表明这表明政府补助在近年来国内企业的研发投入增长中发挥了重要作用,并且企业可通过优化资金渠道次序而使创新投入更优。此外,本文结论亦是对融资优序理论的拓展与补充,表明该理论在异质性企业与差异化经济环境中适用性不同。