猪肉一直以来都是我国人民最主要的肉类消费品。随着人们生活水平地不断提高,人们对优质猪肉的需求越来越大。为了满足消费者对优质猪肉的需求,我国很多科研院所与养猪企业联合共同致力于优质猪肉品种的培育。在这种背景下,本试验室与江西山下投资有限公司合作,共同培育优质肉猪父本——山下黑猪。山下黑猪是以巴克夏为父本,以里岔黑猪为母本,通过杂交育种培育而成。本研究以651头巴里杂交猪（巴克夏公猪与里岔母猪杂交后代,即山下黑猪）、233头巴里鲁莱杂交猪、87头杜洛克巴里杂交猪、53头里岔黑猪和68头鲁莱黑猪为研究对象,肥育至105 kg左右进行屠宰测定。屠宰测定时从左侧胴体采集9-12肋间的背最长肌肌肉样品,分别于45 min和24 h对肉质性状进行测定,记录这两个时间点的肉色评分、大理石纹评分、p H值、a^*值、b^*值和L^*值以及24 h的剪切力,并利用Food Scan肉类/食品成分快速分析器检测肌肉样品的肌内脂肪含量。同时采集肌肉组织样品,带回试验室提取基因组DNA。利用SAS统计分析软件,检验性别对肉质性状的影响,并计算肉质性状间的简单相关系数。利用“中芯一号”猪50K SNP芯片进行基因型检测。然后使用R语言的Gen ABEL包进行全基因组关联分析（GWAS）,鉴别与肉质性状关联的基因组位点。与此同时,通过PCR-RFLP技术检测MYH3基因内6 bp缺失位点与肉质性状之间的关联。总体而言,阉公猪的肉质比母猪的肉质要好,尤其是24 h的肉质。在性别间,除大理石纹评分（P<0.0001）外,45 min肉质性状均没有显著差异;除a^*值、肉色评分和剪切力外,24 h肉质性状均差异显著。45 min的肉质性状与其24 h对应的肉质性状之间都呈极显著的正相关（r≥0.1719,P<0.0001）,且大部分性状的相关性都比较强。GWAS一共检测到12个染色体区域与肉质性状关联,其中基因组显著位点4个。最显著关联的SNP为CNC10121195,位于12号染色体55.05 Mb,它与9个肉质性状显著关联,其中7个达基因组显著水平。它与24小时a^*值的关联程度最强(P=3.78×10^-20),有利等位基因A的加性效应为1.195±0.112。MYH3基因的6碱基缺失突变位点与45 min大理石纹评分（P=0.0227）、24 h大理石纹评分（P=0.0220）、24小时b^*值（P=0.0202）和肌内脂肪含量（P=0.0023）显著关联,与另外5个GWAS显著关联的肉质性状无显著关联,其关联程度均低于对应肉质性状GWAS最强关联SNP的关联程度,且大部分性状的显著水平低于几个甚至十几个数量级,因此在本群体中可以排除MYH3基因的6碱基缺失突变位点是该基因组位点的因果突变位点。通过GWAS,在12号染色体55.05 Mb鉴别了一个影响多个肉质性状的主效位点,并排除MYH3基因的6碱基缺失突变位点为该基因组位点的因果突变位点。由于该基因组位点控制的肉质性状多、效应大,因此值得深入研究,为山下黑猪肉质性状的分子育种提供理论依据。