毛霉病致病菌组学分析及不规则毛霉感染致病机制中DGK的功能初探

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第一部分毛霉病致病菌统计及主要致病菌基因组学分析目的:了解全球毛霉病致病菌构成,比较分析毛霉目真菌毒力相关特异性基因的表达情况。方法:(1)PUBMED数据库检索毛霉病致病菌相关报道文献并进行整理分析。(2)对四株主要毛霉病致病菌株进行线粒体基因组的二代测序。(3)对四株菌株进行全基因组二代测序,结合NCBI数据库中全基因组数据对毛霉目真菌与非毛霉目真菌进行泛基因组学分析。结果:(1)综合2000年1月到2021年6月间1078个毛霉病病例的分析结果,发现根霉属、毛霉属和横梗霉属是目前毛霉病的主要致病菌属。(2)四株毛霉目真菌的线粒体基因组组成在原始序列、GC含量和orf基因排列方面均存在差异,而rrnl基因在这四株菌中表现出保守性。(3)毛霉目真菌存在与编码STE/STE20蛋白激酶、GH36和sell重复蛋白基因相关基因的表达差异。编码毒力蛋白的基因ID112092、cotH3、gcn4和igp1具有开发毛霉病相关检测靶点的潜力。结论:毛霉病在全球范围内的致病病原菌以根霉属、毛霉属和横梗霉属为主,毛霉目真菌种属之间的致病力差异与线粒体基因组拷贝数及相关基因片段有关,同时编码差异表达蛋白的核基因有用于开发毛霉病特异检测靶点的潜能。第二部分中国不规则毛霉感染情况及其转录组学分析目的:分析中国地区不规则毛霉感染病例的临床特征,研究菌株生物学特征与致病力之间的关系以及相关的感染机制。方法:(1)不同温度下培养25株不规则毛霉菌株,观察不规则毛霉表型差异。(2)大蜡螟感染模型验证不同不规则毛霉菌株之间的毒力差异,探析不规则毛霉菌株高温耐受与毒力之间的相关性。(3)RNA测序比较并分析不同温度下不规则毛霉的转录组学差异。结果:(1)不规则毛霉最适生长温度是30℃,35℃环境中生长会受不同程度抑制,37℃环境中生长停滞。(2)35℃环境中生长更佳的菌株在大蜡螟模型中有更强的毒力。(3)部分温度差异基因与不规则毛霉菌株的毒力相关,GH16蛋白和Hsfs蛋白与菌株的毒力呈负相关,Ras样蛋白2和DGK-ε则呈现正相关性。(4)随着环境温度的升高,所有菌株表现出CE4家族和NADP依赖的ME蛋白在转录水平上的升高。结论:不规则毛霉菌株的高温耐受能力不同,部分差异蛋白表达与菌株生长和毒力存在相关性。第三部分DGK与不规则毛霉温度耐受相关性初探目的:揭示Ⅰ型DGK抑制剂抑制DGK-ε后不规则毛霉菌株生长情况,挖掘DGKs在不规则毛霉致病差异性中的作用机制。方法:通过Biosense微生物生长动态监测系统对不规则毛霉菌株生长状态进行监测,使用油红染色定量中性脂质水平以及GC-MS色谱质谱仪定量脂肪酸含量,以评估不同温度生长及抑制剂处理前后菌株脂质代谢的改变。结果:与30℃生长条件相比,35℃的高温环境中,B50m菌株和B50a菌株对DGK抑制剂的耐受明显更高,同时B50m菌株比B50a菌株表现出更明显的抑制情况。此外,B50a菌株在高温下出现了脂肪酸含量的下降,B50m菌株则出现了脂肪酸堆积,Ⅰ型DGK抑制剂的加入会进一步增加B50m菌株脂肪酸的合成,同时B50m菌株的中性脂质含量也表现出与脂肪酸相同的变化特征。结论:(1)B50m菌株对Ⅰ型DGK抑制剂的耐受更高,高浓度作用下才表现出菌丝生长的抑制。(2)B50m菌株较之B50a菌株在高温下存在更多的脂肪酸和中性脂质。(3)Ⅰ型DGK抑制剂可通过调控不规则毛霉菌株脂质代谢水平,尤其是高毒力菌株。
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