甘蓝型油菜GSS-SSR标记开发及含油量QTL定位

来源 :华中农业大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:zhangzhao322
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
高含油量育种一直是油菜品质育种的主要目标之一。油菜含油量是复杂的数量性状,受微效多基因控制,易受环境的影响。随着分子标记技术的发展及遗传连锁图谱的构建,油菜含油量的QTL定位取得了一定的进展。目前芸薹属已发表并被定位的SSR标记位点数目将近1,000个,与水稻、大豆相比,油菜的分子标记数量是很少的,远不能满足油菜基因定位和分子标记辅助育种的需求,因而有必要大规模开发SSR标记。本研究中,我们利用公共数据库中甘蓝型油菜的Genome surveysequences(GSSs),自主开发了一批甘蓝型油菜GSS-SSR标记,并将其用于构建遗传连锁图。另外,利用高含油量亲本M201和低含油量亲本M202构建的F2:3家系及重组自交系F5群体对甘蓝型油菜的含油量进行了QTL分析,检测到了一系列控制含油量的QTLs。在此基础上,我们构建了主效QTL近等基因系,为主效QTL的精细定位及克隆奠定了基础。主要结果如下:1)从公共数据库中下载了13,794条甘蓝型油菜的GSSs,用SSR搜索工具对这些序列进行搜索,发现2,113条序列包含了2,578个不同重复类型的SSR。设计了627对SSR引物,并用6个甘蓝型油菜品系检测标记扩增效率和多态性水平。引物平均扩增成功率达到93.4%,平均多态性水平为73.4%,SSR长度与多态性间无显著相关性。用在亲本No.2127和ZY821间存在多态性的153个GSS-SSR标记构建了基于SSR的遗传连锁图谱。其中136个标记(对应于163个BnGMS位点)定位到相应的连锁群上,17个标记未能定位到连锁图上。构建的遗传连锁图包括19个连锁群,共有163个BnGMS位点和196个锚定标记位点。连锁群长度1,821.33 cM,标记平均间距5.07 cM。2)以高含油量亲本M201与低含油量亲本M202构建了F2:3家系和重组自交系F5群体,群体大小分别为162和157个家系。利用F2及RILsF5群体分别构建了甘蓝型油菜SSR分子标记连锁图。用F2群体构建的遗传连锁图全长1,374.87 cM,共有个221标记位点,标记平均间距6.22 cM;用F5群体构建的遗传连锁图全长1,945.21 cM,包括239个标记位点,标记平均间距8.14 cM。3)分别利用2007年和2008年的F2:3实验数据对含油量进行了QTL定位分析。在2007年检测到7个QTLs(qOC07F3-C2,qOC07F3-A9-1,qOC07F3-A9-2,qOC07F3-A9-3,qOC07F3-A10,qOC07F3-A7-2和qOC07F3-C4),2008年检测到4个QTLs(qOC08F3-C1,qOC08F3-A8,qOC08F3-A9-3,qOC08F3-A10),其中qOC07F3-A9-3和qOC08F3-A9-3的置信区间重叠,qOC08F3-A10和qOC08F3-A10的置信区间也重叠,说明它们是相同的QTL,将它们分别重新命名为qOCF3-A9-3和qOCF3-A10。用混合线性模型对2007年和2008年的F2:3实验数据进行两位点互作分析,没有检测到互作对,只检测到2个含油量主效QTL qOCF3-A9-3和qOCF3-A10,表明含油量主要受加性效应的影响。在2008年,利用重组自交系F5含油量数据检测到5个QTLs(qOC08F5-A9-1,qOC08F5-A9-2,qOC08F5-A10,qOC08F5-A7和qOC08F5-C6),其中qOC08F5-A9-2与qOCF3-A9-3位置一致,qOC08F5-A10与qOCF3-A10位置一致,说明它们是同一个QTL,将它们分别重新命名为qOC-A9-3和qOC-A10。4)利用各株系的蛋白质表型数据,对F2:3群体和重组自交系F5群体的含油量进行了条件QTL分析。结果表明:控制含油量的QTLs可以分成两种类型,一种属于一因多效型,如qOC08F3-A8,即同时控制含油量和蛋白质;另外一种属于条件独立型QTL,如qOC-A10,即仅仅控制含油量。控制含油量的2个主效QTLs qOC-A9-3和qOC-A10均为条件独立型QTL。5)根据主效QTL置信区间基因型及表型数据,从重组自交系RILsF5群体筛选了2株在qOC-A9-3和qOC-A10目标区段分别是杂合基因型的单株,将其自交,形成分离群体,构建了在F2:3和F5群体中能多年重复检测到的两个主效QTLs的近等基因系群体。
其他文献
乙醛脱氢酶(ALDH)是生物界中常见的一种酶类。依赖于辅酶NAD(P)+,乙醛脱氢酶负责把代谢中各种醛类氧化成对应的羧酸。基于蛋白序列的差异,所有已知乙醛脱氢酶分为22个家族,不
传统的模型参考(MRAS)转速辨识是基于永磁同步电机理想的参考模型,要想准确地辨识出电机的转速需要准确地知道电机各种参数,但由于电机运行在不同条件下会导致参数发生变化,使得辨
本课题主要围绕硬盘分区表进行研究,首先对硬盘做一个简要的说明,接着介绍硬盘分区表的结构以及如何在分区表进行查找。最后分析硬盘分区表出现故障的原因以及修复方法,阐述
本文利用集总电路模型,用微带高、低阻抗线实现环形电桥,组成180°功分器,用于四线螺旋天线的激励.由于利用半集总参数设计思想,功分网络的尺寸减小了一半.
本文从理论上阐述了测试电容传声器灵敏度随时间变化的物理机制和规律,并给出了实验结果。
分析了成都市2000—2005年的城市垃圾产生量,运用GM(1,1)SSODMM对成都市2006—2013年城市生活垃圾产生量进行了预测,模型预测精度达到一级。并指出该模型可进一步推广应用于南方其
回 回 产卜爹仇贱回——回 日E回。”。回祖 一回“。回干 肉果幻中 N_。NH lP7-ewwe--一”$ MN。W;- __._——————》 砧叫]们羽 制作:陈恬’#陈川个美食 Back to yield