杏(prunus armenniaca L.)原产我国,属于蔷薇科杏属(Armeniaca)植物。目前,国内因杏品种之间的亲缘关系以及遗传背景不明确,导致品种命名混乱,生产中同名异物或同物异名现象大量存在,限制了优良品种的选育、引种和推广。本研究通过ISSR标记和形态标记方法,对39个杏品种的亲缘关系及遗传多样性进行了系统分析,目的在于揭示我国杏种质资源多样性、丰富度以杏种、品种之间的亲缘关系和分类地位,旨在为优新杏品种选育及核心种质库建立提供理论依据。主要研究结果如下:1、通过正交设计,建立了杏ISSR-PCR最佳反应体系(20ul):1.5U Taq DNA聚合酶、2.0 mmol/L MgCl2、0.15 mmol/L dNTPs、0.35μmol/L引物、30-60ng模板DNA。其中Taq DNA聚合酶和Mg2+浓度是影响ISSR-PCR反应的主要因素。2、从50条随机ISSR引物中筛选出18条扩增条带清晰、多态性好的引物,共扩增出153条谱带,其中多态性条带132条,多态性比率达86.3%,表明供试杏种质资源极为丰富。3、ISSR标记UPGMA聚类法按照地理生态群将供试材料分为4组,中亚生态群组、欧洲生态群组、华北生态群组及仁用杏类群,表明杏具有较强的地理分布集中性。4、杏种质的22个数量性状调查结果表明:各性状差异及变异系数较大,变异度在0.119～0.845之间,变异系数均高于10%,说明各供试材料之间遗传差异较大。5、通过对杏种质的22个数量性状聚类,将39份杏种质聚类为7组,杏品种不是严格按地理生态群来聚类,这与ISSR标记聚类结果不吻合。通过与前人研究结果对比, ISSR标记可以作为一种更有效、更准确的遗传分析工具。