我国是世界公认的养猪大国,在全球养猪生产中占重要地位。猪的生长、胴体及肉质性状作为主要的经济性状,一直是育种工作的重点。猪的生长性状主要包括增重(Weight gain, WG)、饲料转化效率(Feed conversion ratio, FCR)等;胴体性状主要包括背膘厚(Backfat, BFT)、皮重(Skin Weight, SW)及脂重(Fat Weight, FW)等;肉质性状主要包括肉色(Meat Color, MC)、脂肪含量(Fat content, FC)、蛋白含量(Protein content, PC)、水分含量(Water content, WC)等。这些性状均为多基因控制的数量性状。基因通过与通路内或通路间的其他基因的相互作用来实现调控机体生长发育或者代谢活动,所以以单个基因或单个SNP位点作为研究单位存在一定的局限性。因此本研究提出利用候选通路法,挖掘猪生长、胴体及肉质性状相关的候选基因。本文选取猪丙酸代谢通路及脂肪酸代谢通路作为候选通路,将小鼠丙酸通路及脂肪酸通路内的基因比对到猪基因组中初步筛选候选基因,并进一步与PigQTLdb数据库中QTL信息进行映射最终选择了17个候选基因。通过标签SNP位点的提取及潜在SNP位点的预测,共挖掘了57个SNP位点,包括24个标签SNP位点和33个预测SNP位点,并通过SNaPshot方法进行基因分型。利用最小二乘模型,多元多重回归分析模型及MB-MDR方法与猪生长、肉质及胴体品质性状进行关联分析。结果检测出位于基因SUCLA2、SUCLG2、ALDH1B1、ACADS基因上的4个SNP位点与生长性状显著相关;位于基因ACSS1、SUCLG2上的2个SNP位点与肉质性状显著相关,位于基因MUT、MCEE、PCCB上的3个SNP位点与胴体性状显著相关。此外,本文通过基于模型的多因素降维(MB-MDR)方法对通路内基因间的互作效应进行分析,结果发现,单个SNP位点关联分析中并未呈现显著性的位点在MBMDR方法分析结果中呈现极显著性。本文进一步对显著位点进行生物信息学分析,对SNP位点序列的转录因子结合位点进行了预测,结果发现位于基因SUCLG2第1内含子上的多态位点碱基由C突变为T时,原本存在的4个转录因子结合位点消失,出现了转录因子POU1F1的结合位点。通过荧光定量PCR对丙酸代谢通路中与研究性状显著相关的5个基因进行表达量分析,结果发现MCEE、MUT、PCCB、SUCLA2五个基因在9个个体中表现出相同趋势,推断这4个基因可能具有一定的表达调控关系。