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目的:通过对新疆哈萨克族、维吾尔族、汉族三个民族食管癌与癌旁组织比较蛋白质组的研究,寻找癌与癌旁组织差异表达蛋白,为寻找食管癌发生相关蛋白标志物奠定基础。方法:收集哈萨克族、维吾尔族和汉族新鲜食管癌标本各5对,根据病理诊断结果分为高分化癌组、中分化癌组和低分化癌组,以癌旁5cm以外食管粘膜组织作为对照。提取组织总蛋白,进行双向电泳,运用2D platinum软件对得到凝胶图谱进行合成,对比和差异分析,比较和寻找癌与癌旁组织之间表达差异点。将这些差异蛋白点进行肽指纹图分析及蛋白数据库鉴定。应用组织微阵列免疫组织化学方法检测组织中蛋白质表达。结果:与对照组相比汉族食管癌中上调蛋白1个,为ACTB protein,下调蛋白2个,为adenylate kinase1,general transcription factorIIH, polypeptide 1,62kDa;哈萨克族食管癌中上调蛋白6个,分别为COMT protein,Syntaxin binding protein,Pyruvate Kinase(Pkm2),CathepsinD,chromosome1 open reading frame8,giantin;下调蛋白7个,分别为Smooth muscle protein,trangelin,early endosome antigen 1,Annexxin A2,Frbrin beta,tropomyosin;维吾尔族食管癌中上调蛋白6个,分别为heatshock protein 27,Cdc42,proteasome,LLDBP,immunoglobulin,TNF;下调蛋白0个;组织微阵列免疫组化验证哈萨克族食管癌组织中PKM2蛋白表达阳性。结论:成功鉴定出新疆三个民族食管癌与癌旁组织差异蛋白以及三个民族之间癌组织差异蛋白,并且利用组织微阵列免疫组化验证了PKM2蛋白在哈萨食管癌中表达为阳性,表明PKM2蛋白在哈萨克族食管癌与癌旁组织中的表达是有差异的。