在知识产权侵权案件中,或是知识产权权利人自行取证往往难度很大,亦或是取证后证据往往也不能自证其说。然而基于公证的国家公信力和法律直接赋予了公证证据的优越性,这时候知识产权权利人自然而然就转向了公证机构,通过依靠公证机构出具公证文书的形式来提取和固定证据。在知识产权诉讼的审判实践中,虽公证证据在知识产权侵权诉讼证据群中已经处于核心地位,但仍不免有存在瑕疵的现象,导致其合法性、真实性、关联性常常受到质疑,产生知识产权诉讼中出现了如何规范瑕疵公证证据、能否直接优先适用瑕疵公证的困境,甚至还造成了同一个案子在不同级别的法院、同一个案由不同地域的法院在瑕疵公证证据效力方面的采信分歧。因此,在把握知识产权公证证据司法适用价值取向的基础上,针对实践中出现的问题,结合各地法院审理和实践经验,提出一套切实可行的解决问题的基本思路,以此来规范知识产权诉讼在瑕疵公证证据中出现的问题。除引言和结语外,全文分为四个部分:第一部分是知识产权诉讼中瑕疵公证证据的定义和表现。从定义和证据表现两个维度出发,对公证证据为何会在知识产权诉讼适用中“大有可为”厘清脉络。第二部分为我国知识产权诉讼中瑕疵公证证据进行争议分析。通过分析司法实践中存在的典型案例,对知识产权诉讼中公证证据的瑕疵类型进行了梳理,明晰知识产权诉讼涉及瑕疵公证证据的具体问题。不论是理论还是司法案例中存在的问题,都一一凸显,以便深究其问题背后的原因。第三部分是针对上述的问题类型,究其瑕疵背后产生的原因,有:尚未建构有效的公证规范体系、知识产权商业维权的批量取证、公证机构的自身原因等为下文的规范作出了应有的铺垫。第四部分是为解决瑕疵公证证据带来的适用难题,紧接着从立法层面、司法层面、操作层面提出了如下建议:在立法层面,完善公证规范体系,规范公证证据;在司法层面,首先,以确立效力认定的原则为出发点,其次,审慎认定瑕疵公证证据效力,明确效力认定的标准,最后,制定统一的专门化操作规则、建立常态化联动机制;在操作层面,制定统一的专门化操作规则,健全完善各项操作制度,逐步形成一个适合知识产权类案件的操作程序。