在党的十八大以来，党中央把生态文明建设放在治国理政的重要战略地位，大力度推进生态文明建设，环保工作部署频次密集，大气、水、土壤污染防治三大战役相继打响，中央和省级的环保督察一浪接一浪，环保监察执法始终保持高压状态，处罚企业数量和金额连年增长，环保监管压力已然变得越来越大。当前整个环保队伍士气低落、人员归属感不强、人才流出大于流入，环保人员普遍存在厌战情绪，认为干得越多，责任就越多，被问责的风险就越大，因而纷纷寻求其他出路。如果不解决及时这些问题，将会严重影响了生态文明事业的发展。然而，环保部门作为国家行政体制的组成部分之一，一般情况下均与其他职能部门一样，执行国家统一制定的各项规章和规定，导致其内部机制的调整空间极小，系统的激励机制容易出现固化。在行政体制稳定性强的特点下，一旦出现机制固化的情况，体制内的局部调整将困难重重，只有遇到由上而下的行政体制改革期才可能实现调整。环保部门作为本轮机构改革的涉改部门，即将面临机构、人员、资源的重新整合以及制度机制的重新建立，这将是对内部机制进行调整的重大机遇，是全面优化当前的激励机制不可多得的一个机会。
　　本文以肇庆市环保系统为例，针对该系统目前激烈机制的现状，结合激励原理、激励的范畴、激励的制度安排与途径以及企业的激励文化等方面对当前国内激励理论研究的一些主要成果，通过采取问卷调查法、实地访谈法、比较分析法等方法，对肇庆市环保系统当前激励机制存在的问题作较全面的总结和分析，并结合新一轮机构改革的实践经验，提出了利用机构改革的契机优化肇庆市环保系统激励机制的对策建议，丰富了借助机构改革优化市级环保系统激励机制的理论在解决环保系统目前存在的一系列问题的应用。