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本研究从8名HIV-1感染者外周血单个核细胞基因组DNA中扩增HIV-1包膜基因,构建包膜表达载体,经筛选共获得13个具有完整开放阅读框架的阳性克隆,进行了序列测定。并利用生物信息学方法分析了包膜基因共享序列和结构变化。
本实验8个感染者体内病毒为B亚型,并与河南分离株CNHN24、云南分离株RL42和LTG0218遗传距离较近;综合CoRbd、V3的氨基酸残基、糖基化位点、净电荷的变异及其对细胞亲嗜性影响的分析结果,发现04030的Env符合所有X4毒株的性质,并且,04030与同期感染的病人相比病情较重,预测04030黑龙江分离株为X4亲嗜性;而长期暴露但未发病的HIV-1阳性者03009体内病毒Env的氨基酸序列、中和表位和结构变异程度均较小,且病毒为R5亲嗜性,表明该感染者体内病毒相对较稳定。