培养条件对农杆菌VBP蛋白平行同源基因表达的影响

来源 :扬州大学 | 被引量 : 4次 | 上传用户:mindy27
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
农杆菌(Agrobacterium tumefaciens)是一种能使部分双子叶植物发生冠瘿瘤疾病(crown gall disease)的病原菌,其致病机理是通过转运自身Ti质粒上的一段DNA(简称T-DNA)到宿主细胞中,并整合到宿主基因组中进行表达,使宿主细胞发生遗传转化,因而使宿主产生冠瘿瘤。如果把Ti质粒上的T-DNA用所需的目的DNA取代后,农杆菌同样可以把外源的T-DNA转运到宿主细胞中从而能使宿主细胞发生遗传转化。农杆菌是以蛋白质-单链-T-DNA复合物(简称T-复合物)的形式来转运这段T-DNA。T-复合物是通过四型分泌系统(T4SS)转运到宿主细胞中。农杆菌T-复合物的转运需要很多蛋白的参加,其中有一个重要的蛋白VirD2蛋白,用VirD2蛋白做诱饵,分离出一种能与VirD2蛋白相互作用的蛋白,称为VirD2结合蛋白(VirD2-binding-protein, VBP)。通过基因序列分析发现,农杆菌中还有两个额外的基因可以编码与VBP1高度同源的蛋白称为VBP2、VBP3蛋白。与VBP1一样,VBP2、VBP3蛋白也可以与VirD2蛋白结合。vbp1基因位于隐性质粒At(cryptical plasmid)上,另外两个同源基因vbp2、vbp3位于线性染色体上,且距离很近。VBP蛋白在农杆菌T-DNA转运过程中起着招募T-复合物到农杆菌两端的T4SS的作用,影响T-DNA转运效率,因此,VBP蛋白又被称为T-复合物招募蛋白。已有的研究证实,三个vbp基因在行使T-复合物招募功能方面可以相互替代,其中一个或两个基因失去功能之后,剩下的任何一个或两个基因都具有招募T-复合物的功能,只有三个vbp基因同时被敲除掉之后的农杆菌突变株才会失去招募T-复合物的功能,从而表现出很低的T-DNA转运效率。这说明野生型农杆菌细胞中的三个vbp基因都能表达出有功能的蛋白,而且只要有其中的一个vbp基因表达就足以实现招募T-复合物的功能。野生型的农杆菌细胞中同时存在三个vbp基因,如果在不同的诱导条件下这三种蛋白都表达,这对细菌基因组来说是一种浪费。在通常情况下是三个基因都表达,还是只表达其中的一个,而剩下的两个则被关闭,又或者是三个基因的表达分别受不同的生存环境或生理条件的调控,在某种生存状态下只表达某个同源基因,而在另一种状态又可能同时表达两个或三个同源基因。所以弄清楚这三个基因是不是在细胞中同时表达,它们的表达是不是受诱导条件或细胞生理状态的调控,三个基因之间是否有相互的调控关系,其中某个vbp基因的表达是否会影响其它两个同源vbp基因的表达是至关重要的。因此,本文研究了培养条件对这三个vbp基因表达的影响。结果发现,在所试验的各种培养条件下,各种农杆菌菌株的vbp1、vbp3基因都表达,且vbp1与vbp3基因之间没有调控关系,说明这两个基因可能是组成型表达,不受培养条件的调控。与vbp1和vbp3不同, vbp2基因的表达具有一定的选择性,在高温、高pH值以及低AS浓度下表达。vbp2基因与vbp1基因之间存在一定的调控关系,在缺vbp1基因的GMI9017菌株中,只有高pH条件下vbp2基因才表达。
其他文献
学位
报纸
学位
学位
学位
由于人类活动,淡水生态系统不可避免地受到农药、重金属等的污染,这些污染物会对水生生物包括初级生产者、消费者和分解者产生影响,因此,有必要了解这些污染物的危害情况。本研究中,我们构建以掌肢新米虾Neocaridina palmata(十足目:匙指虾科)和沉水植物金鱼藻Ceratophyllum demersum(双子叶植物:金鱼藻目)为主的室内淡水系统,在静态和半静态下测试保幼激素类似物苯氧威对米虾
学位
报纸
学位
基于sigmoid激活函数,建立了一种BP神经网络模型。通过对某高中2006年至2015年间的高考平均数据样本进行学习,修正了权值和阈值。系统最大相对误差为0.22%,关联度为0.6667,小误差概率为0.98,方差比为0.0002,预测结果精度为高。用于2016年至2020年间该校高考平均成绩的预测中发现,预测结果与实际结果的最大绝对误差仅为2分。对该校2021年的高考平均成绩进行了预测,最终预