S1P磷酸酶2调节胰岛β细胞增殖和内质网应激的关键基因筛选及文献计量学分析

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目的:探究S1P磷酸酶2(S1P phosphatase 2,SPPase2)调节胰岛β细胞增殖和内质网应激的关键基因。应用文献计量学的方法探讨关键基因研究领域的进展趋势和研究前沿。方法:GSE73131芯片数据集来自GEO数据库,选取SPPASE2基因敲除与野生型小鼠差异表达的基因,构建蛋白互作分析网络(Pro-tein-Protein Interaction,PPI),将关键基因用STRING和Cytoscape软件进行模块化以分析锁定关键基因。通过分析从1986年至2020年之间的Web of Science科学扩展数据库检索的相关文献,使用CiteSpace和VOSviewer软件对国家,机构,作者,关键词等对关键基因相关文献进行文献计量学共现分析。结果:与野生型小鼠相比,SPPase2基因敲除组小鼠共筛选出150个上调基因和30个下调基因,其涉及到的功能主要集中在1型糖尿病、趋化因子信号通路、细胞因子与细胞因子受体的相互作用、细胞黏附分子、产生IgA的肠道免疫网络方面。模块化分析后最终确定了一个枢纽基因,即CD48基因。对CD48基因进行文献计量学分析,发现最近十年出版物的数量基本维持在年均20-30篇的增幅。美国(n=115,43.7%),中国(n=32,12.2%),德国(n=29,11.0%)是CD48基因研究领域全球文章贡献量最大的三个国家。此外,哈佛大学(n=15,美国)、耶路撒冷希伯来大学(n=14,以色列)、美国食品和药品监督管理局(n=9,美国)是发文量排名前三的机构。CD48相关的研究细胞类型随着时间的推移分别为2012年左右的自然杀伤细胞、嗜碱性粒细胞、吞噬细胞,到2014年左右的红细胞、血小板、基质细胞,再到2016年附近的造血干细胞,以及2018年前后的血液白细胞和2020年最近的自噬细胞。结论:对于鞘脂代谢异常引发的糖尿病,CD48基因可能是潜在的研究和治疗靶点基因。目前CD48研究在血液系统疾病的方面相较其它系统的疾病更充分,其余内分泌系统如糖尿病相关研究开展甚少,因此研究潜力较大。
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