近年来，现代物流与供应链管理广泛应用到医药行业，我国的医药体制改革也进入了关键时期。与之联系紧密的供应链绩效评估体系，不仅能够对供应链管理的实施进行有效的核算和评估，更可以指导管理者进行有效的决策。为了使得医药供应链健康地可持续发展，建立科学、行之有效的医药供应链绩效评价体系已经成为一个迫切需要解决的问题。本文在对国内外供应链及其绩效评价的研究现状分析的基础上，在分析我国医药供应链的现状后，对各个节点企业的绩效进行了评价，并提出了措施建议和改进意见。进一步结合各种绩效评价体系的优点，在模糊数学的理论基础上，建立了医药供应链绩效模糊综合评价模型。同时，进行了模型原型计算及评价过程的数据模拟，找出当前医药供应链实际运作中的根源性问题并提出相关的建议措施。文章最后是对医药供应链绩效评价的展望。