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目的:本文试图利用Affymetrix公司的基因表达谱芯片对胰腺癌病人PBMC的表达谱和正常人PBMC表达谱进行研究,筛选胰腺癌的肿瘤相关基因,为胰腺癌的临床诊断和治疗提供新的途径。 方法:收集5名胰腺癌病人和5名健康志愿者的外周静脉血并提取PBMC的总RNA,分别与含38500个基因的美国AFFYMETRIX公司HUMAN GENOME U133 PLUS 2.0ARRAY基因表达谱芯片杂交。杂交后进行图像扫描和数据分析。并使用real-time RT-PCR对部分筛查结果进行验证。其中OLFM4和MMP9使用的是普通TaqMan荧光探针,CCDC18使用的是TaqMan-MGB荧光探针。 结果:表达谱芯片结果显示,在10个样品中至少有一个“Present”的signal值的probe set有22000个。10个样品的signal值全部为“Present”的probeset有11160个,信号值取log10的值后,进行Student’s t test(two-taileddistribution;two-sample unequal variance),肿瘤组PBMC表达倍数在0.5倍以下和2倍以上的,且t检验p值小于0.01的probe set对应基因有10条,其中3倍以上表达的基因只有一条基因——MMP9,没有0.333倍以下表达的基因。在22000条基因中除去10个样品的信号值全部为“Present”的11160条probeset,剩下的10840条probe set中,发现了两条基因很可能成为新的肿瘤MARKER——OLFM4(NM006418)和CCDC18(NM206886)。 Realtime RT-PCR结果显示,OLFM4与MMP9在胰腺癌PBMC中呈上调表达趋势,而CCDC18在胰腺癌PBMC中呈下调表达趋势,这与芯片的结果一致。其中OLFM4在胰腺癌病人PBMC中明显高于正常对照组(P<0.05)。