肝脏缺血再灌注损伤是肝脏手术或者肝移植后,造成肝脏功能紊乱或者衰竭的主要原因。然而,目前临床上对于肝脏缺血再灌注损伤仍然缺乏有效的治疗手段。因此,深入的研究肝脏缺血再灌注损伤的分子机制,寻找调控肝脏缺血再灌注损伤的关键因子和信号通路,可以为肝脏缺血再灌注损伤治疗的新策略提供科学依据,为临床防治提供潜在靶点。为了系统地探究肝脏缺血再灌注损伤的调控机制,本研究通过对SRA公共数据库与ProteomeXchange蛋白组数据库中肝脏缺血再灌注不同时期的转录组与蛋白组数据进行表达模式的分型与功能富集分析,从转录水平与蛋白水平分别阐述了肝脏缺血再灌注损伤不同阶段发生显著改变的生物学事件与信号通路,然后进行联合分析,以期寻找到在肝脏缺血再灌注损伤中的关键因子和信号通路。在转录水平上,肝脏缺血再灌注损伤可以划分成代谢紊乱-Kupffer细胞活化-炎症爆发-细胞死亡-损伤修复-功能恢复六个阶段。经过进一步的分析,我们发现再灌注0~6 h阶段的炎症反应与凋亡应答可能与肝脏的损伤程度有直接的关系。因此,我们将目光聚焦在了肝脏缺血再灌注早期的炎症激活与凋亡应答阶段,并借助Animal TFDB数据库筛选出Egr1等12个在缺血再灌注早期高表达的转录因子,他们可能调控着缺血再灌注早期的炎症激活。同时,我们通过相关性分析筛选出了一批与炎症、凋亡应答负相关的分子,它们可能具有抗炎、抗凋亡的作用。蛋白水平的分子事件改变不如转录水平明显与有序,直到再灌注的12 h阶段,才出现了较为明显的炎症反应。因此,在蛋白水平上,我们更注重于直接寻找与肝脏缺血再灌注损伤相关的功能蛋白。通过蛋白互作网络分析,我们发现Serpina蛋白家族、Apo蛋白家族与炎症之间的紧密联系,同时我们通过相关性分析与DisGeNET数据库发现Tollip、Sod2等调控炎症、凋亡过程的分子与肝脏缺血再灌注损伤的发生发展具有显著的关联。这些分子可能成为肝脏缺血再灌注损伤的标志物或者有效治疗靶点。