肝癌相关异常DNA甲基化的关键基因筛选及临床意义研究

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目的:肝癌是我国最常见的恶性肿瘤之一,具有相对较高的发病率和死亡率,而DNA异常甲基化与肿瘤发展密切相关。本研究旨在探讨肝癌中异常DNA甲基化在肝癌发生、发展中潜在的作用机制,筛选出与肝癌发病、预后相关的异常甲基化分子生物标志物,并探索其与肝癌临床病理学特征的相关性。方法:本研究中首先利用GEO筛选肝癌中异常甲基化-差异表达基因,利用Metascape做功能富集分析,利用Cytoscape做蛋白互作网络分析及重要模块基因筛选。然后使用UALCAN数据库进行重要模块中异常甲基化-差异表达基因的验证,进一步再联合R语言使用TGCA肝癌数据筛选影响肝癌预后的甲基化靶基因,并进行甲基化Cp G位点生存和相关性分析。最后对筛选的关键甲基化靶基因行GSEA富集分析,以及甲基化靶基因与临床病理特征的相关性分析。结果:本研究鉴定出5个甲基化靶基因BRCA1,CDCA5,DTL,PTTG1,CDCA3在肝癌中呈现低甲基化-高表达状态,可能参与肝癌进展,与肝癌分期、分级及淋巴结转移状态相关,且影响肝癌患者预后,对肝癌具有潜在预后价值,同时鉴定了肝癌预后相关的甲基化Cp G位点,具有潜在的甲基化靶向药物开发价值。甲基化靶基因在肝癌中与细胞周期,碱基切除修复,同源重组,DNA复制,P53信号通路,错配修复异常激活有关,对研究肝癌潜在的分子发病机制具有巨大价值,有成为肝癌潜在治疗靶点的可能。结论:甲基化靶基因BRCA1,CDCA5,DTL,PTTG1,CDCA3参与肝癌进展,具有成为肝癌预后生物标志物和治疗靶点的潜能。
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