目的：　　食管鳞癌是食管癌的主要病理类型之一，在亚洲国家相对高发，我国是世界上食管鳞癌最主要高发国。食管鳞癌发病往往难以察觉，来医院就诊的食管鳞癌患者大多数为中晚期，已失去最佳治疗时机，而且其靶向治疗药物尚未见成功研究报道。毫无疑问，在基因层面深入开展食管鳞癌分子机制研究，将十分有助于食管鳞癌靶向治疗药物研发。基于此，本文通过整合分析总共12批食管鳞癌二代测序与表达谱数据，使用多步过滤筛选方式，寻找食管鳞癌驱动基因，并进一步对食管鳞癌发生发展机制进行诠释，同时预测其靶向治疗药物。　　方法：　　通过使用一种综合性方法识别食管鳞癌驱动基因，重点考虑基因的突变位置，突变类型，突变数量与突变比例，设置判别标准；其次，利用GO与KEGG数据库对驱动基因进行功能富集与通路的注释；再次，使用随机生存森林与排列组合的方法挑选驱动基因，并选取收益最高的7个驱动基因构建预测食管鳞癌患者预后分子标签组合；最后，利用表达谱与RNA-seq数据获得驱动基因的表达量，放入cennectivity map与LINCS等药物重利用数据库，预测食管鳞癌靶向治疗药物。　　结果：　　⑴共识别出156个食管鳞癌驱动基因，包括CLSTN2，KDM6A，EP300， TP53，NOTCH1，NOTCH2，NOTCH3，MLL1，MLL2等。⑵利用GO与KEGG数据库注释，确定了食管鳞癌驱动基因发挥作用的生物学功能通路。⑶筛选出一组食管鳞癌驱动基因，包含APOB、PTCH1、NOTCH1、EP300、NBEAL2、ZNF750和TRPM3，构建一食管鳞癌患者预后预警分子标签组合，预测食管鳞癌患者生存期。⑷利用食管鳞癌的表达谱与RNA-seq数据，获取上述食管鳞癌驱动基因的表达情况，同时结合其在基因组层面上的特征性改变，对这些食管鳞癌驱动基因的分子作用机制进行深入解析。⑸预测得到了靶向食管鳞癌驱动基因的药物，包括二甲基亚砜、两性霉素B、氯丙嗪和醋氨心安等。　　结论：　　成功获得了食管鳞癌驱动基因。在此基础上，进一步解析了主要食管鳞癌驱动基因发挥其功能的通路及其机制；同时还成功构建一食管鳞癌患者预后预警分子标签组合，用于指导预测食管鳞癌生存期；最后还预测了食管鳞癌靶向治疗药物。这十分有助于我们从基因分子层面深入揭示食管鳞癌发生发展机制，同时对寻求更加有效的食管鳞癌预后预警方法，探索食管鳞癌靶向治疗药物也有重要意义。