21世纪创新引领发展,创新效率的提升是推动供给侧结构性改革的重要内容。本文基于区域创新的视角,在实证的前半部分,首先构建了测度2007-2016年省域创新效率的DEA、SFA以及Bootstrap-DEA的面板模型,其次对我国省域、三大地区和八大经济区域的创新效率的动态趋势、排名及其变化进行分析,然后采用σ收敛模型检验其时空的收敛性质,最后依据Bootstrap-DEA的测度结果,绘制了中国区域创新地图。研究结果显示:(1)传统的DEA模型存在明显的高估偏误,未加入环境因素的SFA模型参数偏误较大,Bootstrap-DEA测出的创新效率值具有更小的偏差;(2)专利申请与专利授权作为产出变量测出的效率值区别不大;(3)2007-2016年全国平均创新效率呈现U型过程曲线,东部沿海地区的创新效率遥遥领先,但地区与经济区域之间存在“追赶效应”;(4)全国的创新效率σ收敛指数基本呈现L型过程,省域创新的效率差距在逐渐缩小,区域创新活动有一定的空间集聚现象。本文研究结论得到若干政策启示,为进一步提高我国省域创新效率提供了依据。在实证的后半部分,以2011-2015年中国31个省域的专利活动数据为研究样本,基于加入环境因素的SFA模型,对中国区域创新效率进行了测算和分析。研究结果表明:(1)加入环境因素的SFA模型较基础SFA模型的测度结果更加可靠,也更加符合经济现实情况;(2)5年来,中国专利产出的平均效率保持良好增长势头,各省市专利产出效率也保持平稳缓慢增长;(3)从专利产出的投入要素和环境因素看,中国的专利产出基本属于高效集约式的增长方式。但从专利产出的空间结构看,全国专利产出效率呈现不均衡和个别省份专利产出效率低下的问题;(4)在专利产出效率的弹性分析中,R&D经费投入和人员投入都处在边际产出递增阶段。在影响专利产出的诸多环境因素中,R&D项目数和经济水平对专利产出效率有着明显的正向效应。最后,本文以中国省域专利的平均产出及其效率为基础数据,绘制了中国专利产出地图和区域创新地图。