南沙区地处珠江入海口和珠江三角洲经济圈的几何中心，位于珠江出海口虎门水道西岸，是西江、北江、东江三江汇集之处，是广州市唯一的出海通道，也是广州市海域面积最大的区域，全区岸线约240公里，海域面积约220平方公里，占全市海域总面积近70%，约占全区总面积的28%，拥有海岛12个，其中面积大于500平方米的海岛有10个；南沙区海岸线长、海岛多，且濒临南海，近海和远洋资源较为丰富，区位条件良好，海洋科技优势明显，海洋事业的发展在广州市中占有无可代替的位置。“海洋是全球生命支持系统的基本组成部分,是一种有助于实现可持续发展的宝贵财富。”只有合理开发和有效利用海域,才能实现海洋可持续发展。但是,随着海域使用强度的加大、开发的深入带来了新的问题，主要是环境、资源和管理三大问题。不同行业、不同单位在开发利用海域的过程中，只注重本行业、本部门的利益，缺乏统一协调和综合管理。这些，都直接或间接地影响了海域资源的合理开发利用和海域环境的保护改善。国家“十二五”规划纲要明确提出南沙新区开发，把南沙新区提升到“深化粤港澳合作，建设中华民族共同家园”的新高度。国务院批复的《南沙新区发展规划》在国家层面赋予了南沙新区在海洋管理领域的先行先试权，包括推进海域资源市场化配置进程，完善海域使用权招拍挂制度，探索建立海域使用二级市场；依法开展环境影响评价工作，在不破坏海岸带、海域和海洋生态系统功能的前提下，严格执行围填海计划，统筹海岛保护、开发与建设；对重大项目用海的围填海计划指标给予倾斜等。此外，允许南沙新区对符合海洋功能区划和土地利用总体规划的区域按照相关政策依法申请使用海域，优化申报程序，探索用海管理与用地、供地管理衔接试点。把握南沙新区面临的机遇与挑战，是谋划未来南沙新区海洋发展定位和发展重点的首要条件。本论文主要是在调查南沙区海洋开发现状的基础上，详细分析南沙区海洋开发过程中存在的体制、经济、环境保护和海洋管理等相关问题，立足于国家海域使用管理相关制度，通过分析对比国内外海洋管理模式，运用经济学、管理学的外部性理论和可持续发展等理论对南沙区海洋管理中存在的问题进行综合研究，提出加强南沙区海洋综合管理的对策措施和思路构想，维护好国家海域所有权和海域使用权人的合法权益。