【摘 要】
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[目的] 研究加系SPF 大白、长白猪SLA-1 基因的多态性.[方法]采取15 头大白猪和22头长白猪血液,分离外周血淋巴细胞,提取总RNA,反转录cDNA,设计特异性引物进行RT-PCR扩增
【机 构】
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牡丹江师范学院生命科学与技术学院,牡丹江157011
【出 处】
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2016第十四届中国北方实验动物科技年会
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[目的] 研究加系SPF 大白、长白猪SLA-1 基因的多态性.[方法]采取15 头大白猪和22头长白猪血液,分离外周血淋巴细胞,提取总RNA,反转录cDNA,设计特异性引物进行RT-PCR扩增测序,获得等位基因序列进行多态性分析.[结果]成功获得16 个SLA-1 等位基因,其中4个为新等位基因,由ISAG SLA 命名委员会命名为SLA-1*0703、SLA-1*0704、SLA-1*0811、SLA-1*0812.在全长1086bp 的完整开放阅读框(ORF),核苷酸多样度(Pi)为0.04559,单倍型多样度(Hd)为0.00049,平均核苷酸差异数(K)为49.508,150 个核苷酸变异位点中简约信息位点远高于单一多态位点；共编码361 个氨基酸产生183 个突变,非同义突变远高于同义突变.胞外区a1、a2 存在33 个关键氨基酸,其中9 个为保守氨基酸,其余24 个均发生高频率突变,它们共同构成了6 个抗原肽结合槽口袋(A-F).[结论]本研究成功鉴定了16 个SLA-1 等位基因,具有高度的多态性,且高变区集中于第2、3 外显子,对SPF 大白、长白猪构建动物模型具有至关重要的作用.
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