转座子(transposon)是可以通过不同转座机制可转移的DNA 分子。转座子的分布十分广泛,从原核生物到真核生物的大多数生物基因组中都能发现转座子。转座子可以通过引起基因组序列的删除、扩增、倒位、移位、断裂等重排作用扩充生物的遗传多样性。毛竹基因组中含有多类转座子。此次主要研究毛竹基因组中各类转座子插入的偏好性,分析各类转座子在不同基因间区的分布情况。以毛竹基因组为材料,下载毛竹基因组中的外显子序列、内含子序列、启动子序列等,利用毛竹基因组数据库和Repeat Masker 软件计算出各类转座子在基因附近位置的含量。在对毛竹基因中转座子的数据研究中,结果发现每类转座子在不同区域的含量各不相同：除Unknown-class 以外,LTR 类的转座子含量明显高于DNA 类转座子；而在LTR 类转座子中,Gypsy 和Copia 两个家族的转座子含量最高,在DNA 类转座子中,MUDR 和Fn-SPm 家族的高倍数明显高于其他DNA 类转座子。根据各类转座子在基因组上的实际分布和理论分布,我们对这些数据做卡方检验分析,最后发现：当自由度为25时各类转座子的X2 均明显小于卡方值,所以这些转座子的分布含量符合理论含量。由此可见,转座子的分布是具有选择性的,每一类转座子的插入都影响毛竹的生长发育。深入的研究转座子在毛竹基因组中的分布有助于我们进一步的了解毛竹基因组的组成和进化以及对毛竹各组织器官的影响。