肠道菌群培养法是目前研究药物代谢的主要方法之一，并且肠道菌群的平衡状况与宿主的健康和疾病有着密切的关系，中药和肠道菌群的相互作用对研究中药药效以及胃肠道消化系统疾病具有重要的意义。本课题通过在研究戊己丸配伍方中的君药黄连的两种生物碱在人源肠道菌群中的代谢，首先采用L9 (34)正交设计法将黄连、制吴茱萸、土炒白芍配伍成9组戊己丸方和相应剂量的黄连单味药，分别与人的新鲜粪便进行厌氧培养，采用HPLC-UV法同时测定孵育不同时间的菌液中小檗碱和巴马汀的含量，比较在不同配伍比例下两种成分的代谢。结果可见：(1)在黄连提取物中，小檗碱的代谢速度与剂量呈正相关，巴马汀的代谢速度与剂量呈负相关；(2)复方配伍加速了低剂量小檗碱的代谢，与土炒白芍成呈正相关；而减缓了高剂量小檗碱的代谢，代谢速度与制吴茱萸呈负相关。(3)复方配伍加速了高剂量巴马汀的代谢，减缓了中低剂量巴马汀的代谢，且代谢速度与制吴茱萸和土炒白芍的剂量呈负相关。本研究发现：黄连、制吴茱萸、土炒白芍比例不同，小檗碱和巴马汀的代谢速度有一定的差异；当黄连代表成分在肠道菌群中代谢较快时，戊己丸复方配伍减缓其代谢速度，反之，戊己丸复方配伍则加快其代谢。