加权基因共表达网络分析药物致心脏毒性特征

来源 :2015年(第五届)药物毒理学年会 | 被引量 : 0次 | 上传用户:songyinming
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  目的 分析药物致心脏毒性的基因表达特征,进而筛选出潜在的药物致心血管毒性损伤的生物学标记物。方法 本文使用加权基因共表达网络分析(WGCNA)方法分析了88种药物且不同剂量共计208例实验的大鼠心脏组织基因组表达谱数据,计算表达谱中基因节点的相异系数构建分层聚类树;计算模块本征基因与组织病理严重程度的相关度,鉴定与药物致心脏损伤临床终点相关的基因共表达模块;对共表达模块中的基因进行功能注释以及富集度分析进而进一步揭示模块中基因的生物学功能,主要参与的代谢通路、与之相关的疾病等信息。
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